Кожний рівень ЄДС має координуючі та постійні органи управління.
Координуючі органи ЄДС загальнодержавного рівня:
державна комісія з питань техногенно-екологічної безпеки та надзвичайних ситуацій;
Національна рада з питань безпечної життєдіяльності населення;
В окремих випадках для ліквідації надзвичайної ситуації та її наслідків рішенням Кабінету міністрів України створюється спеціальна Урядова комісія.